Cell | 建立人类树突状细胞与正因如此T细胞相互作用模型

肝细胞-肝细胞电磁场间歇性复杂，涵盖大量原子与接收器通道，学界所学多年，仍旧是管中会窥豹。来自法国巴黎PSL研究大学的Vassili Soumelis团队于在Cell杂志上撰写篇文章A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的发表文章，创设了实验者与理论三维融为一体的研究方法，实验者上，在蛋白质水平检验了肝细胞所分泌的肝生长因子与应激反应；理论三维上，创设了接收器输入控制器之除此以外的从外部联系和电磁场关联。译者以生命锥状状肝细胞（Dendritic cell，亦称DC）与辅助性T肝细胞（T Helper cell，亦称Th）之除此以外的电磁场为研究具体来说，量化了36例DC相关的接收器原子和17种Th分泌的肝生长因子，并倚靠这些数据库创设物理现象，演算显现出56种早就被实验者表明的肝细胞相互关联，与此同时，还断定显现出290种确实关联，并表明了IL-12p70可以通过IL-1接收器通道更进一步17型辅助性T肝细胞（亦称Th17）。首先，译者采集了生命单核肝细胞缺少的DC（MoDCs）和外周肝脏CD11c+DC（bDCs）两类肝细胞，并诱因24时长。所选用的诱因接收器主要包含三大类共14种。第一种：内源接收器原子，包括特异性beta（interferon β，亦称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll；也介导的底物，包括Toll4介导的拮抗剂脂多糖（ lipopolysaccharide，亦称LPS），Toll1/2介导拮抗剂PAM3CSK4，Dectin1拮抗剂Curdlan，Toll2/Dectin1拮抗剂 zymosan，Toll7/8介导拮抗剂R848，Toll3介导拮抗剂 poly(I：C) 和NLRP3发炎小体活化剂铝钾；第三种：细菌病毒，包括高温灭活的Candida albicans （亦称HKCA），李斯特菌（Listeria monocytogenes，亦称HKLM），Staphylococcus aureus （亦称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （亦称HKSP）和大肠杆菌（influenza virus，亦称flu）。接仍然，译者通过流式肝细胞术等方法，检验了36种DC相关原子的暗示情形，其中会，29种正处于肝细胞表层，7种正处于肝细胞分泌上清之中会。调查结果，除了一些已确定的DC肝细胞组织起来之外，译者还有了一些原先发掘显现出：（1）zymosan诱因的MoDCs 暗示高水平的CD54 和PVR；（2）大肠杆菌诱因的MoDCs可以更进一步ICOSL；（3）LPS诱因的MoDCs 可以更进一步高水平的CD30L和CD83。再仍然，译者将这些诱因过的DC与T肝细胞粗略估计6天，随后检验Th的增殖高效率以及17种Th相关肝生长因子的暗示分泌情形。有趣的是，译者将Th和DC的展现相互来得，发掘显现出，这二者之除此以外并不存在一一对应的关联，意味著，两种诱因物对DC造成了的缺点类似，但是，这两种诱因物所处理的DC与T肝细胞粗略估计以后，造成了的缺点很可以迥然有所不同。接着，译者选用数据库量化的方法，以上述实验者数据库创设三维。来得简单来说，译者示范DC控制器的36种接收器原子和Th控制器的17种效应原子，将两两之除此以外的关联简化为“更进一步抑制”和“一般而言抑制”两种，并且，还加入数据库源和已撰写文献资料中会的的资讯，创设了复杂的接收器抑制在线。例如，通过这一三维，译者发掘显现出， IL-10的一般而言抑制原子包括OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而更进一步抑制原子包括Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这；也，给予DC有所不同的诱因接收器，译者就可以说明了Th组织起来肝细胞IL-10的暗示分泌情形。最终，译者利用这；也三维，试左图断定并表明原先肝细胞相互关联。通过创设的三维，译者发掘显现出，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2一同分泌时，保守于抑制IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 一同显现出现时，则更加保守于抑制IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的暗示水平都引人注意降低。这些结果说明，IL-12参与Th17的更进一步并存。为了进一步阐述IL-12更进一步Th17的功能，译者选用体外更进一步Th的三维，发掘显现出，IL-12并不能从外部更进一步Th17，但是，同时加入IL-1和IL-12，Th17就更进一步显现出来了。这是一篇实验者与理论三维融为一体的佳作。实验者结果与计算物理现象相互支持，相互监督，互相配合。如下左图标明，实验者部分选用了密切关联两部分数据库，一是何种诱因下DC肝细胞的组织起来，二是组织起来后的DC对T肝细胞的作用。理论三维部分以DC和T肝细胞的控制器肝生长因子为核心，创设了肝生长因子之除此以外的更进一步和一般而言抑制在线三维。通过这一三维，译者才会有一些原先肝细胞除此以外相互关联，就此再用实验者表明这些关联前提确实。这篇发表文章的亮点有两处，一是创设和实验者理论三维融为一体研究的时是，二是发表文章中会提供的诸多肝细胞抑制的资讯以供研究参考。原始显现出处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.