Ann Neurol-结肠癌vs晚发的重症肌无力,在基因组学上有何差异?

2022-02-14 12:00:55 来源:
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心绞痛关节炎是一种自身免疫性病症,临床上表现为身体勉强柯尼呼吸困难。大约80%的心绞痛关节炎患者都有针对神经元后身体内板的胺类酶(AChR)的自身病原体。有趣的是,这些有AChR病原体的患者在胃癌时有一个双峰的系统,早期高峰在30岁约,中期高峰在70岁约。

早症(EO)和晚症(LO)的心绞痛关节炎兼具明显的临床和法医学相异之处。大多数EO患者有以生发中都心为相异之处的甲状腺增生,而这些相异之处在LO患者中都不常用。此外,甲状腺瘤涉及的心绞痛关节炎是另一个独有的社会阶层,这些患者几乎都有可检测到的AChR病原体和性病症病症。这些推论结果背后的功能仍未解决,但相异的生物化学间接地已被提出来解释EO和LO方式的心绞痛关节炎二者之间的差异。

近期的正因如此性状组关连性学术研究(GWAS)挖掘出了一些心绞痛关节炎的遗传学安正因如此性核糖体,备有了对潜在病症功能的一瞥。这些学术研究验证,相异的遗传学安正因如此性因素有可能最大限度EO和LO心绞痛关节炎的胃癌功能。比如说的是,主要组织相容性复合体(MHC)核糖体内的相异遗传学个体差异会造成了EO和LO病症。此外,通过GWAS也挖掘出了MHC均的几个安正因如此性核糖体;例如,TNIP1性状附近的遗传学安正因如此性个体差异与EO病症有关,而TNFRSF11A性状附近的个体差异则与LO病症有关。尽管取得了初步获得成功,但心绞痛关节炎症候群的GWAS比较简单军事力量不足以,而且大多数安正因如此性变体都属于非字节区。因此,心绞痛关节炎的大部分遗传学易感性仍有待阐明。

比如说的是,通过GWAS明确的每个遗传学安正因如此性核糖体都包含许多与病症涉及的合理性状,需有利于的岗位来明确对任何事物核反应有建树的性状。新用到的确实验证,任何事物遗传学个体差异很有可能通过性状表达的变化而产生功能效应,而且往往是以蛋白类别的方式。此外,这些任何事物变体有可能通过染色质尿素通气所在位置性状的表达。

近期牛津的 Lahiru Handunnetthi等人,联合开发了Priority Index,这是一种性状组学方法,将蛋白类别特异的功能性状组数据,如性状表达和染色质组织,与GWAS的挖掘出相结合,以明确病症涉及性状。在这项学术研究中都,他们在以前的岗位基础上,将Priority Index应用心绞痛关节炎的GWAS结果,以明确病症涉及性状,并具体探索EO和LO心绞痛关节炎二者之间的差异。他们使用一种新的性状组方法,将心绞痛关节炎症候群的性状组为广泛关连性学术研究(GWAS)结果与蛋白类别的特定数据(如性状表达的系统和组蛋白-增强子相互作用)相结合,以明确病症涉及的性状。随后,进行了额外的性状组调查,之外对313名人体内的表达定量分析,以备有功能上的立论。

根据GWAS涉及的安正因如此性个体差异,他们挖掘出了与早症关节炎症候群值得注意涉及的性状,之外TNIP1、ORMDL3、GSDMB和TRAF3。

还挖掘出,toll样酶4回波的通气器只能在早胃癌症性状中都富集(富集倍数(fold enrichment)=3.85,p=6.4 x 10-3)。相比之下,T蛋白通气器CD28和CTLA4只与中期胃癌的病症有关。

在CTLA4性状附近挖掘出了两个任何事物遗传学个体差异(rs231770和rs231735;后验均值= 0.98和0.91)。随后,我们验证这些任何事物个体差异造成了CTLA4的低表达(rs231735和rs231770分别为rho=-0.66,p=1.28 x 10-38和rho=-0.52,p=7.01 x 10-22)。

这个学术研究的内涵在于:此学术研究中都挖掘出的病症涉及性状是许多学科的独有资源,之外临床内科医生、科学研究和制药业。与短暂性和晚发心绞痛关节炎涉及的相异的生物化学间接地对制剂再来进行的希望和未来制剂联合开发的学术研究兼具不可或缺象征意义。译者应是;Handunnetthi L, Knezevic B, Kasela S, Burnham KL, Milani L, Irani SR, Fang H, Knight JC. Genomic insights into myasthenia gris identify distinct immunological mechanisms in early and late onset disease. Ann Neurol. 2021 Jul 19. doi: 10.1002/ana.26169. Epub ahead of print. PMID: 34279044.

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