Lancet Oncol:肾透明细胞癌与厌食症悖论相关的转录组特征分析

2021-11-01 18:44:44 来源:
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一.研究背景

肥小孩子性疾病与脾光亮蛋白胃癌 (ccRCC)的可能性减少有关,但肥小孩子性疾病又矛盾地与该的预后有所改善有关,其潜在机制尚不确切。现译者对肥小孩子性疾病高血压和但会体形高血压在原发和结节周脂肪酸三组织里面的甲状腺转换成和免疫转录三组差异性完成研究深入研究。

本文介绍了表观引起的微环境的差异性有助于解释肥小孩子性疾病高血压的生存环境优势(肥小孩子性疾病法则)。

二.深入研究流程三.社论讲解1.COMPARZ缓冲区、TCGA-KIRC缓冲区、MSK免疫病人缓冲区抽样查阅、矫正

在COMPARZ缓冲区的453名高血压里面,有375名(83%)高血压兼具需用的微阵列抽样,病人前BMI测量以及无进展和比起之下生存环境抽样完成深入研究(表1)。除119名(26%)超载高血压外,来自COMPARZ试验的最终缓冲区都有256名(68%)高血压(n=256)。

表1.COMPARZ诊疗试验缓冲区的人均收入数学方法和诊疗形态

TCGA-KIRC缓冲区里面的332亦然高血压里面,评估了经脾切除奥义病人的152亦然(46%)晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC高血压的诊疗和人均收入数学方法抽样(表2)。在考虑59名(39%)超载高血压后,终于获得的缓冲区都有93名高血压(n=93)。

表2.晚期光亮蛋白脾蛋白胃癌TCGA-KIRC缓冲区的人均收入学和诊疗形态

从62亦然MSK周边脂肪酸三组织缓冲区里面完成脾脏切除奥义的非转移性光亮蛋白RCC高血压里面获得了原发性和周边脂肪酸样品。在这个缓冲区里面,从59名高血压的PNN(脾周附近)周边脂肪酸,25名高血压的PNA(游走脾周)周边脂肪酸以及55名高血压的三组织里面频域。在考虑超载高血压之后,最终缓冲区都有41名(69%)PNN抽样高血压, PNA抽样为17(68%),抽样为37(67%)。从最初的203名参与者的MSK免疫病人研究人群里面考虑74名(36%)超载高血压后,总生存环境深入研究的最终缓冲区都有129名(64%)参与者(表3)(n=129)。

表3. 引入MSK免疫病人的诊疗试验缓冲区的人均收入数学方法和诊疗形态

2.肥小孩子性疾病的脾光亮蛋白胃癌高血压相较为但会体形的脾光亮蛋白胃癌高血压总生存环境期更长

根据KM生存环境深入研究,在三三组里面都见到肥小孩子性疾病高血压的总生存环境期更长。在TCGA-KIRC缓冲区里面,经分期校正后,肥小孩子性疾病高血压的比起之下存活期擅但会体形三组;在COMPARZ缓冲区里面,经IMDC可能性评级校正后,小孩子高血压的比起之下存活期也擅但会体形三组。在MSK免疫疗法缓冲区里面,经IMDC可能性评级校正后,BMI与死亡率的无很大差异性(如平面图1)。

平面图1.TCGA-KIRC缓冲区 (A)、COMPARZ 缓冲区(B)和MSK免疫病人缓冲区(C)的总生存环境期

3.COMPARZ缓冲区里面肥小孩子性疾病高血压兼具很好的PFS

对CPMPARZ缓冲区KM深入研究后,KM椭圆推断,COMPARZ缓冲区里面肥小孩子性疾病高血压比但会体形高血压兼具很好的PFS。

平面图S1.COMPARZ缓冲区里面肥小孩子性疾病高血压比但会体形高血压兼具很好的PFS

4.常用梯队抗生素病人,肥小孩子性疾病高血压仍兼具很好的OS

KM椭圆推断了在常用梯队乙酰酪氨酸类固醇(pazopanib或Sunitinib)的两个病人三组里面,肥小孩子性疾病高血压的OS即便如此较但会体形高血压好。

平面图S2.COMPARZ缓冲区常用梯队抗生素病人三组的总生存环境期深入研究

5.COMPARZ缓冲区里面,肥小孩子性疾病与但会体形的高血压转录三组性状形态假定很大差异性

做完上述深入研究,译者在三个缓冲区里面证实肥小孩子性疾病法则假定之后,接下来在COMPARZ缓冲区里面对肥小孩子性疾病和但会体形高血压评估了转录三组学差异性。先是做了Hallmark性状集的GSEA深入研究,较为肥小孩子性疾病高血压与但会体形高血压彼此间的差异性:肥小孩子性疾病高血压里面推断诱发、TGF-β、上皮-间充质发生变化和甲状腺转换成信号渠道很大上调,提示伤口愈合种系统的激活(平面图A)。平面图B是对平面图A筛选的几个表观渠道的Enrichment plots。

平面图S4.COMPARZ缓冲区里面肥小孩子性疾病高血压与但会体形高血压的ccRCC转录三组性状形态假定很大差异性

6.COMPARZ缓冲区与TCGA-KIRC缓冲区 里面肥小孩子性疾病比但会体形高血压的甲状腺转换成评级高

在GESA共通的形态性状集甲状腺转换成评级较为里面,肥小孩子性疾病高血压少于但会体形高血压(如平面图2)。

平面图2.COMPARZ缓冲区(A)与TCGA-KIRC缓冲区 (B)里面肥小孩子性疾病原发高血压与但会体形高血压的甲状腺转换成的z score

7.但会体形与肥小孩子性疾病高血压的免疫蛋白群无很大差异性

对但会体形(7亦然)与肥小孩子性疾病(16亦然)高血压的原发的主要免疫蛋白数量均引入流式蛋白奥义完成评估。平面图A推断了肥小孩子性疾病高血压与但会高血压彼此间的免疫蛋白群的比起之下差异性。平面图B确切推断了肥小孩子性疾病和但会体形高血压T蛋白群的诱发水平。见到但会体形与肥小孩子性疾病高血压的免疫蛋白群无显著差异性,免疫蛋白诱发的程度与BMI无关。

平面图S9.用流式蛋白奥义深入研究但会体形与肥小孩子性疾病高血压的免疫蛋白群无显著差异性

8.与但会体形高血压比起,肥小孩子性疾病高血压结节周脂肪酸三组织增生减少,尤其是附近的结节周脂肪酸

在MSK的非转移性ccRCC高血压的基础性缓冲区里面,译者合并了20个最很大的珍贵的IPA规范渠道,这些渠道来自于肥小孩子性疾病和但会体形高血压的PNN和PNA抽样的较为(平面图A)。肥小孩子性疾病和但会体形高血压的PNN和PNA抽样彼此间的免疫诱发(ssGSEA评级)较为(平面图B)。

平面图S5.与但会体形的高血压比起,肥小孩子性疾病高血压的脾周脂肪酸推断出增生和诱发减少

综上,在COMPARZ试验缓冲区里面,经过IMDC可能性评级调整后,见到相较为但会体形高血压,乙酰酪氨酸类固醇病人提高了肥小孩子性疾病高血压的生存环境率,相当多是接受sunitinib病人的高血压。IMDC可能性评级基本概念都有的三组分间接反映消化道因素对胃癌性疾病更促使增生起着(亦然如贫血,里面性粒蛋白升高,和血小板升高性疾病),这些因素可能也是免疫病人结果和BMI彼此间关联机制的原因。见到肥小孩子性疾病高血压的甲状腺转换成分数少于但会体形高血压,与之前其他的研究结果表明的,参与甲状腺转换成,β-氧化种系统等等性状的硫化物的震荡一致。因此,甲状腺转换成的差异性可以部分解释肥小孩子性疾病高血压接受乙酰酪氨酸类固醇病人后的较好预后。

此研究为肥小孩子性疾病法则提供了微生物学支持。在患有ccRCC的高血压观察到肥小孩子性疾病高血压相较为但会体形的高血压微环境的差异性:相当多是肥小孩子性疾病高血压的的甲状腺转换成减少,但比起之下增生无显著差异性。值得注意的是肥小孩子性疾病高血压的周边脂肪酸推断减少的增生和诱发状况。光亮蛋白胃癌与结节周脂肪酸三组织微环境的多样相互起着可能兼具诊疗意义,值得促使研究。

原始出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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