Mol Cell:张锋再造三合一复合抗病毒的新型CRISPR Cas13系统

全因，麻省理工学院和哈佛大学Broad数据集分析所传来还好：Pardis C. Sabeti、张锋等地质学家联合开发出一种新型的抗染病的系统。在世界上上有许多常见的致命病原体都是基于单链RNA的染病，像是埃博拉染病、寨卡染病和流感染病。该的系统在CRISPR Cas13应用的细化再次更新，可采用仪器和破坏人类文明蛋白质之前具有单链RNA的染病。该数据集分析刊发在《Molecular Cell》月刊上。CRISPR的系统为抗染病法则造成了曙光在此之后，张锋结构设计团队的数据集分析职员凭借着CRISPR/Cas9的系统为修复免疫的系统抵抗染病入侵造成了原先希望。然而，入侵人类文明的染病十分多变，即使是在同一种群内，也能促使受伤害。因此我们需要更为灵活的预防措施染病应用软件。为了追寻原先抗染病策略，数据集分析职员将目光靠拢了CRISPR Cas13的系统，Cas13酶可以天然地载体微生物之前的染病RNA。它可以对蛋白质顺利完成编程，从染病固体之前去掉特定的核糖核酸核酸。尽管CRISPR Cas13的系统仍然假定一些局限病态，但是该法则在研究小组之前较难可用，并且在此之后张锋结构设计团队的数据集分析职员在哺乳动物蛋白质之前已经顺利完成了充分的实验显然。数据集分析职员开发了一种名为CARVER的新型应用软件，它能将Cas13介导的染病RNA裂解与基于Cas13的并能确诊读数结合起来，采用特定的高灵敏度酶报告分子解锁（SHERLOCK）应用软件，仪器消灭基于RNA的染病。创建三合一的的系统数据集分析职员首先筛选了350多个人类文明相关染病（HAV）基因组，以检验Cas13可以有效地载体的染病RNA核酸。他们主要找回的是既更易突变，又最有确实在切割后替换成染病的段落。染病基因组之前潜在的Cas13能够亚基哈佛大学Cameron Sabeti研究小组的博士后Myhrvold博士表示：“理论上，你可以编程Cas13来攻击染病的任何部分。但是种群内部和种群间都有巨大的多样病态，随着染病的进化，大部分基因组都发生了迅速的变动。如果你不小心，你确实会追求终于不会效果的能够。”然后，他们通过计算分析测序数据集，以确定数百种染病种群之前的数千个潜在亚基，这些亚基确实是Cas13的有效地靶标。每一次，数据集分析职员结构设计了该的系统的Cas13指导RNA。新编程的Cas13在染病了淋巴蛋白质病态脉络膜脑膜炎染病（LCMV）、甲型流感染病（IAV）和小便病态口炎染病（VSV）的人类文明蛋白质之前顺利完成了实验测试。将Cas13引进仪器后24小时，数据集分析职员推论到培养物之前染病RNA的高水平提高了40倍。随后，数据集分析职员核对了Cas1抑制染病病毒病态的能力。数据集分析数据集显示：染病渗入后八小时，Cas13将流感染病的染病力提高了300倍以上。终于，该结构设计团队采用SHERLOCK仪器应用来实时测量Cas13载体后的染病RNA高水平。该仪器的系统共享了有关治果的并能反馈以及有关特定染病突变的信息。章中对于染病染病的病患，虽然已经审批了90多种抗病物，但它们只能病患9种疾病。总体而言，只有16种染病具有FDA审批的疫苗。因此，找到不断进步地的抗染病法则显得尤为重要。该数据集分析的第一作者 Catherine Freije 表示：“Cas13可以是一种数据集分析物件，来追寻人类文明蛋白质之前染病生物学的许多多方面，它也确实是一种临床物件，采用确诊样本，病患染病染病，并衡量病患的有效地病态——所有这些都能让CARVER在原先或耐药病态染病消失时迅速适应和应对。”早期注解:PFreije CA1, Myhrvold C2, Boehm CK3, et a1.Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13.Mol Cell. 2019 Oct 2. pii: S1097-2765(19)30698-7. doi: 10.1016/j.molcel.2019.09.013. [Epub ahead of print]